芎菊上清丸具有疏散风热、清热解表、止痛的功效，主要用于治疗外感风邪引起的头痛、头晕、目眩、牙痛、咽喉肿痛等症状。
芎菊上清丸含有菊花、薄荷等成分，有助于疏散风热。外感风热时可能出现发热、头痛、鼻塞等症状，该药可通过解表作用缓解上述不适。使用前需确认无药物过敏史，且不建议长期连续服用超过1周。
药物中的黄芩、连翘等具有清热解毒作用，适用于风热感冒初期出现的咽干口燥、发热畏寒等表证。服药期间应避免食用辛辣油腻食物，若出现皮疹或消化道不适需停药就诊。
川芎、白芷等成分能改善血管收缩异常引起的头痛，对感冒相关性头痛、偏头痛有缓解效果。但高血压或脑血管疾病患者需谨慎使用，头痛持续不缓解应及时就医排查器质性疾病。
对于风热上扰所致的视物昏花、目赤肿痛，药物中的菊花、决明子可清肝明目。服用期间需注意用眼卫生，避免强光刺激，症状加重或伴随呕吐需考虑颅内病变可能。
桔梗、甘草等成分能利咽止痛，缓解风热袭肺导致的咽喉灼痛、吞咽困难。建议配合淡盐水漱口辅助消炎，若咽喉肿痛伴呼吸困难需立即急诊处理。
服用芎菊上清丸期间应忌食生冷油腻，风寒感冒者不宜使用。药物性状发生改变时禁止服用，儿童、孕妇及哺乳期妇女使用前应咨询医师。服药3天后症状无缓解或出现胸闷心悸等不良反应，应及时停药并就医。治疗期间保持规律作息，适量饮用温水，避免过度劳累和精神紧张。慢性疾病患者用药需遵医嘱调整其他药物使用方案。
