肾输尿管结石的主要症状包括腰部或侧腹突发剧痛、血尿、排尿异常等。疼痛常呈绞痛性质，可能放射至下腹部或腹股沟区，伴随恶心呕吐等症状。
肾输尿管结石引起的疼痛多位于患侧腰部或侧腹部，典型表现为阵发性绞痛，疼痛程度剧烈，患者常难以忍受。疼痛可沿输尿管走行方向向下放射至同侧下腹部、腹股沟或会阴部。这种疼痛与结石移动刺激输尿管平滑肌痉挛有关。
血尿是另一常见症状，多数表现为镜下血尿，部分患者可见肉眼血尿。血尿程度与结石对尿路黏膜的机械损伤程度相关。结石摩擦尿路黏膜导致毛细血管破裂出血，形成血尿。
排尿异常包括尿频、尿急、排尿困难等症状。当结石位于输尿管下端接近膀胱处时，可能刺激膀胱三角区，产生膀胱刺激症状。部分患者可能出现排尿中断现象，这与结石位置改变影响尿流有关。
部分患者伴随恶心呕吐、腹胀等消化道症状。这是由于肾盂和输尿管与胃肠道有共同的神经支配，结石刺激引发内脏神经反射所致。严重者可出现面色苍白、出冷汗等休克样表现。
少数患者可能出现发热寒战等感染症状，提示存在尿路感染。这种情况需要及时就医处理，避免感染扩散导致脓毒血症。感染性结石患者更易出现此类症状。
当结石完全阻塞输尿管时，可导致患侧肾脏尿液排出受阻，引起肾积水。长期肾积水可能影响肾功能，需通过影像学检查评估梗阻程度。双侧输尿管结石完全梗阻可能导致无尿，属于泌尿外科急症。
