肉蔻五味丸遵医嘱使用通常安全性较高，但少数情况下可能出现胃肠不适、过敏反应等不良反应。
1. 胃肠不适
肉蔻五味丸含肉豆蔻等辛温成分，部分敏感人群服药后可能出现胃脘胀满、恶心或腹泻等胃肠刺激症状。多见于空腹服用或胃肠功能较弱者，建议餐后服用以减轻刺激，持续不适需停药就医。
2. 过敏反应
个别患者对组方中藏药成分如广枣、木香等可能存在过敏风险，表现为皮肤瘙痒、红疹或呼吸困难。首次用药建议观察半小时，出现过敏症状应立即停药并抗过敏治疗。
3. 头晕乏力
该药具有镇静安神功效，少数患者用药后可能出现轻度嗜睡、头昏等中枢神经系统反应，通常适应后减轻。服药期间应避免驾驶或高空作业等需高度集中注意力的活动。
4. 肝功能异常
长期大剂量使用可能影响肝脏代谢功能，极少数病例报告转氨酶升高。慢性肝病患者需定期监测肝功能，出现食欲减退、黄疸等症状应及时就医。
5. 药物相互作用
与镇静类药物联用可能增强中枢抑制作用，与抗凝药合用或增加出血风险。合并用药前应告知医生正在服用的药物，避免潜在相互作用。
使用肉蔻五味丸期间应保持饮食清淡，避免辛辣油腻食物加重胃肠负担。服药后适当休息有助于药效发挥，避免剧烈运动引发不适。储存时需置于阴凉干燥处，防止药材变质影响疗效。若不良反应持续或加重，应及时复诊调整用药方案。
