龟鹿补肾丸主要用于治疗肾阳虚引起的腰膝酸软、头晕耳鸣、畏寒肢冷等症状，同时适用于男性性功能障碍如阳痿早泄、女性月经不调等病症。
1、肾阳虚证
龟鹿补肾丸可改善肾阳虚导致的腰膝酸软、神疲乏力。肾阳虚患者因阳气不足，常伴随小便清长、夜尿频繁，该药通过鹿角胶、龟甲胶等成分温补肾阳。临床常配合金匮肾气丸、右归丸等药物使用，服药期间需避免生冷饮食。若出现口干舌燥等阴虚症状应停药。
2、性功能障碍
对男性勃起功能障碍和早泄有辅助治疗作用。其成分中淫羊藿、巴戟天能促进性激素分泌，但严重器质性病变需联用西地那非片或他达拉非片。女性性欲低下者应在医生指导下配合坤宝丸使用，妊娠期禁用。
3、神经衰弱
适用于肾阳不足引起的失眠健忘、注意力不集中。方中熟地黄、枸杞子可调节中枢神经功能，与安神补脑液联用效果更佳。长期失眠需排查焦虑症等原发疾病，避免依赖药物。
4、筋骨萎弱
针对骨质疏松、关节冷痛等症状，尤其适合中老年退行性病变。龟鹿二仙胶能促进钙质吸收，但骨折患者需先进行骨复位。风寒湿痹患者可配合独活寄生汤使用。
5、月经不调
对肾阳虚型月经后期、经量过少有调理作用。菟丝子、当归可调节下丘脑-垂体-卵巢轴功能，但需排除多囊卵巢综合征等器质性疾病。更年期综合征患者建议配合雌二醇片使用。
服用龟鹿补肾丸期间建议适度进行八段锦、太极拳等温和运动，饮食上增加羊肉、核桃等温补食物。糖尿病患者应注意制剂中的蜂蜜含量，高血压患者服药期间需监测血压变化。过敏体质者首次服用应减半剂量观察，连续用药超过2周需复查肝肾功能。服药后出现心悸、皮疹等不良反应应立即停药就医。
