启脾丸不宜与含有人参的滋补类药物、抗菌药物、消化酶制剂、酸性药物以及泻下类药物同时使用。启脾丸由人参、白术、茯苓等成分组成，具有健脾和胃的功效，与其他药物联用可能影响药效或产生不良反应。
启脾丸本身含有人参成分，若与其他人参制剂如生脉饮、参苓白术散等同服，可能导致人参过量。过量摄入人参可能引起心悸、血压波动等不良反应，尤其对高血压患者风险更高。两类药物功效相近，重复使用可能加重脾胃负担。
四环素类、喹诺酮类等抗菌药物可能与启脾丸中的金属离子结合形成螯合物，降低抗菌效果。启脾丸所含矿物质与抗菌药物联用会干扰肠道菌群平衡，影响药物吸收。建议间隔两小时以上服用，避免相互作用。
胰酶、多酶片等消化酶制剂与启脾丸联用可能相互影响作用机制。启脾丸通过调节脾胃功能改善消化，而消化酶直接补充外源性酶，两者作用途径不同。同时使用可能导致消化液分泌紊乱，出现腹胀或腹泻。
维生素C泡腾片、阿司匹林等酸性药物可能改变启脾丸中有效成分的溶解性。酸性环境会使部分中药成分分解加速，降低健脾效果。长期联用还可能刺激胃肠黏膜，引发胃部不适症状。
大黄、番泻叶等泻药与启脾丸的健脾止泻作用相拮抗。启脾丸用于脾虚泄泻，而泻下类药物促进肠道蠕动，可能抵消其疗效。两类药物联用会导致胃肠功能紊乱，加重原有症状。
服用启脾丸期间应避免饮酒及辛辣刺激性食物，以免影响药效。脾胃虚弱者需注意饮食清淡，适量食用山药、小米等易消化食物。用药期间如出现恶心、皮疹等不适，应立即停药并咨询医师。慢性病患者联合用药前需告知医生正在服用的所有药物，确保用药安全。中药调理需遵循疗程，不建议自行增减剂量或搭配其他药物。
