药物流产和无痛人流对身体的伤害程度，需要根据终止妊娠时的孕周、孕妇自身健康状况以及术后恢复情况等多方面因素综合判断，无法简单比较哪一种伤害更小。
药物流产和无痛人流各有其优点。药物流产无须手术器械进入宫腔，避免了子宫穿孔、宫颈损伤等手术相关风险，对子宫内膜的机械性损伤相对较小，适用于停经49天内的宫内妊娠。无痛人流在静脉麻醉下进行，手术过程无痛感，能有效避免因疼痛导致的紧张、恐惧等心理应激反应，且手术时间短，医生在可视条件下操作，妊娠组织清除相对更彻底，可降低因流产不全导致二次清宫的概率。
药物流产和无痛人流也各有其缺点。药物流产过程较长，出血时间可能持续1-2周，出血量有时会超过月经量，存在流产失败或不全流产而需要再次手术清宫的风险，且服药后可能出现恶心、呕吐、腹痛等明显的药物副作用。无痛人流作为一种宫腔操作手术，存在麻醉风险，术后可能发生宫腔粘连、感染、月经失调等远期并发症，对子宫内膜可能造成一定损伤。
无论选择何种方式终止妊娠，都对女性身体是一次损伤。术后必须充分休息，加强营养摄入，多食用富含优质蛋白和铁的食物如瘦肉、鸡蛋、动物肝脏以促进身体恢复。术后一个月内禁止盆浴和性生活，注意会阴部清洁，观察阴道流血情况，如出血量超过平时月经量或持续时间过长，需及时返院复查。同时应重视心理调适，必要时可寻求专业心理支持。最重要的是，如果没有生育计划，应积极采取科学可靠的避孕措施，避免重复流产对身心造成更大伤害。
