长期服用避孕药可能引起月经紊乱、血栓风险增加、肝功能异常等不良反应，但多数危害与个体差异和用药规范有关。避孕药的主要副作用包括胃肠道不适、乳房胀痛、情绪波动、体重变化、皮肤色素沉着等，通常可在医生指导下通过调整用药方案或定期监测降低风险。
部分女性服用避孕药后可能出现恶心呕吐、食欲减退等胃肠道反应，多发生在用药初期，通常1-3个月后逐渐缓解。短效避孕药如屈螺酮炔雌醇片可能引起突破性出血，表现为非经期阴道点滴出血，这与子宫内膜适应性改变有关。含雌激素的避孕药可能使凝血功能异常者发生静脉血栓的概率上升，尤其吸烟者或35岁以上女性风险更显著。少数人服药后出现黄褐斑等皮肤色素沉着，这与孕激素刺激黑色素细胞活性相关。长期用药者需定期检查肝功能，因炔雌醇等成分需经肝脏代谢，可能引起转氨酶轻度升高。
有乳腺癌家族史者使用避孕药需谨慎，虽然现有证据未明确证明其致癌性，但高剂量雌激素可能刺激乳腺组织增生。偏头痛患者服用避孕药可能加重头痛发作频率，尤其是有先兆偏头痛者更易出现脑血管收缩异常。极少数情况下，避孕药可能诱发胰岛素抵抗，糖尿病患者用药期间需加强血糖监测。对于存在严重高血压或心脑血管疾病者，医生通常会建议改用屏障避孕法。有肝腺瘤病史者禁用避孕药，因雌激素可能促进肿瘤生长。
建议每年进行妇科检查、乳腺超声和肝肾功能检测，服药期间出现持续头痛、胸痛、视觉异常等需立即就医。可通过补充维生素B族减轻恶心症状，增加膳食纤维摄入预防便秘，适度运动帮助维持正常凝血功能。选择低剂量孕激素制剂或非口服避孕方式可减少副作用，具体用药方案应经妇科医生评估后个体化制定。
