治疗尖锐湿疣没有所谓“最好”的药物，治疗方案需根据疣体大小、数量、部位及患者身体状况个体化选择，常用药物主要有咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊、氟尿嘧啶乳膏、干扰素凝胶以及三氯醋酸溶液。
一、咪喹莫特乳膏
咪喹莫特乳膏是一种免疫调节剂，通过刺激局部产生干扰素等细胞因子来发挥抗病毒和增强免疫的作用，从而清除人乳头瘤病毒感染和疣体。它适用于治疗外生殖器和肛周尖锐湿疣，尤其对于体积较小、数量较多的疣体有较好效果。使用该药物时，部分患者可能出现局部皮肤红斑、水肿、糜烂等刺激反应，通常无须停药，但若反应严重应暂停使用并咨询医生。该药物为处方药，必须在医生指导下使用，不可自行购买涂抹。
二、鬼臼毒素酊
鬼臼毒素酊属于细胞毒性药物，能够抑制疣体细胞的分裂，导致疣体坏死、脱落。它主要用于治疗直径较小、数量不多的尖锐湿疣。使用时需精确涂抹于疣体上，避免接触周围正常皮肤黏膜，否则可能引起灼伤、疼痛和溃疡。该药物使用周期和频率有严格限制，过量使用可能导致全身吸收中毒，出现恶心、呕吐等不良反应。患者务必遵医嘱使用，不可擅自增加用药次数或面积。
三、氟尿嘧啶乳膏
氟尿嘧啶乳膏是一种抗代谢类药物，通过干扰疣体细胞的DNA合成，抑制其生长，最终促使疣体消退。它可用于治疗多发性、表浅性的尖锐湿疣。该药物局部刺激性较强，可能引起涂抹部位明显的疼痛、炎症、色素沉着甚至溃疡。治疗期间需要密切观察皮肤反应，孕妇禁用。由于其对正常细胞也有一定影响，必须严格按照医生规定的剂量和疗程使用，不可长期大面积涂抹。
四、干扰素凝胶
干扰素凝胶具有广谱抗病毒和免疫调节功能，可以直接抑制人乳头瘤病毒的复制，并增强机体局部细胞免疫能力来清除疣体。它常作为辅助治疗手段，用于预防尖锐湿疣在物理治疗后的复发，或治疗亚临床感染。局部使用相对安全，不良反应较轻微，可能包括瘙痒、灼热感等。但该药物起效较慢，需坚持使用较长时间。使用前应清洁患处，均匀涂抹薄层即可。
五、三氯醋酸溶液
三氯醋酸溶液是一种化学腐蚀剂，通过使疣体蛋白凝固、坏死而达到去除目的。通常由医护人员操作，用于治疗较小、角质化程度不高的尖锐湿疣。治疗时需精准控制药液用量和范围，操作不当易损伤周围健康组织，导致疼痛和疤痕形成。一次治疗可能无法完全清除，常需多次重复进行。治疗后局部会形成痂皮，应保持清洁干燥，让其自然脱落，不可强行撕扯。
药物治疗是尖锐湿疣综合管理的重要一环，但通常需与冷冻治疗、激光治疗、电灼或手术切除等物理方法联合应用，尤其是对于较大、顽固或复发的疣体。在整个治疗期间，患者应保持患处清洁干燥，穿着宽松透气的棉质内衣，避免搔抓以防自身接种传播。同时，应戒烟限酒，保证充足睡眠，均衡营养，适当锻炼以增强全身免疫力，这对防止复发至关重要。由于尖锐湿疣具有传染性，在未治愈前应避免性接触，性伴侣也应接受检查。定期复查至关重要，即使疣体清除后，也应遵医嘱随访一段时间，以监测是否复发或存在亚临床感染。任何用药方案都应在皮肤性病科医生全面评估后制定，切勿听信偏方或自行用药。
