鼓膜修补术存在一定风险，但整体安全性较高。手术风险主要与麻醉意外、术后感染、听力恢复不佳、移植物排斥、眩晕耳鸣等因素有关。
鼓膜修补术作为耳科常规手术，技术已相对成熟。手术通常在显微镜下操作，医生会根据鼓膜穿孔大小选择自体筋膜、软骨膜或人工材料进行修补。术中可能因麻醉药物过敏或基础疾病引发循环呼吸系统异常，但发生率极低。术后需保持耳道干燥避免感染，部分患者可能出现短暂眩晕或耳鸣，多数在1-2周内自行缓解。移植物排斥反应较为少见，与个体免疫状态和材料选择相关。
特殊情况下风险可能增加。慢性中耳炎活动期患者术后易发生感染，需提前控制炎症。咽鼓管功能障碍者可能影响移植物存活率，需同期处理。既往有耳部手术史或广泛瘢痕体质者，手术难度增大可能导致听力改善有限。极少数患者会出现味觉异常或面神经刺激症状，多与术中神经牵拉有关。高龄或合并糖尿病等慢性病患者，术后愈合速度可能较慢。
术后应避免用力擤鼻、游泳及乘坐飞机，防止修补部位受压。建议定期复查听力检测恢复情况，出现耳痛、流脓等异常及时就诊。保持均衡饮食有助于组织修复，适当补充维生素C和优质蛋白可促进愈合。术后三个月内避免耳道进水，洗澡时可使用防水耳塞保护。
