藿香正气丸主要用于治疗外感风寒、内伤湿滞或夏伤暑湿所致的胃肠型感冒，以及晕车晕船引起的恶心呕吐等症状。该药具有解表化湿、理气和中的作用，主要适应证包括暑湿感冒、胃肠功能紊乱、腹泻呕吐、脘腹胀痛等。
一、暑湿感冒
藿香正气丸适用于夏秋季因感受暑湿之邪引起的感冒，常见症状为发热头痛、胸闷恶心、肠鸣腹泻等。暑湿感冒多因气候潮湿闷热导致人体湿邪内阻，该药中的广藿香油、紫苏叶油等成分能发散表邪，白芷、半夏等可燥湿和中。
二、胃肠功能紊乱
对于饮食不节或寒湿侵袭引起的胃肠功能失调，表现为脘腹胀满、食欲减退、肠鸣泄泻等症状时，可用该药调理。方中白术、茯苓健脾祛湿，陈皮、厚朴行气消胀，对功能性消化不良有缓解作用。
三、急性胃肠炎
因食用生冷腐败食物或感受外邪导致的急性胃肠炎症，出现呕吐泄泻、腹痛肠鸣时，可配合使用该药。其止吐成分姜半夏、生姜能温中止呕，苍术、茯苓可利湿止泻，但细菌性肠炎需联合抗生素治疗。
四、晕动症
乘车船时出现的眩晕恶心症状，可在出发前服用藿香正气丸预防。其中紫苏叶、白芷有镇静抗眩晕作用，生姜能抑制胃肠逆蠕动，但严重晕动症患者需结合地芬尼多等专用药物。
五、水土不服
因地域气候环境改变引起的消化系统不适，如腹胀腹泻、食欲不振等，该药可帮助调节胃肠功能。广藿香的芳香化湿作用能促进消化液分泌，桔梗宣肺气以助脾胃运化，需注意排除感染性腹泻。
使用藿香正气丸期间应避免生冷油腻食物，酒精可加重药物副作用须禁用。风寒感冒无湿滞症状者不宜服用，糖尿病者慎用含糖剂型。服药3天后症状未缓解或出现皮疹、心悸等不良反应时应停药就医。湿热型腹泻伴脓血便或高热的肠炎患者不宜自行用药，孕妇及哺乳期妇女使用前需咨询医师。
