清宫寿桃丸的不良反应尚不明确，但任何药物都可能存在个体差异，部分人群可能出现胃肠不适、过敏反应等。
清宫寿桃丸是一种中成药，其不良反应在药品说明书中通常记载为尚不明确。这并不意味着该药物绝对安全，而是指在常规临床试验和上市后监测中，未发现明确、常见且与药物有直接因果关联的不良反应。在临床实际使用中，由于患者体质、基础疾病、用药剂量及合并用药等因素的差异，个别患者仍可能出现一些不适反应。较为常见的关注点集中在胃肠系统，部分脾胃功能较弱或对药物成分敏感的患者，可能在服药后出现胃部不适、腹胀、食欲下降或大便性状改变等情况。这些反应通常是轻微和暂时的，在调整服药时间或减少剂量后可能缓解。此外，作为含有多种植物性药材的复方制剂，理论上存在引发过敏反应的风险，虽然发生率很低，但敏感体质者可能出现皮肤瘙痒、皮疹等症状。极少数情况下，若患者未遵医嘱长期过量服用，或与其他药物不当联用，可能增加肝肾负担，但这并非该药物的典型不良反应。药物的安全性高度依赖于辨证施治和规范使用，因此必须在中医师指导下服用。
服用清宫寿桃丸期间，应密切观察身体反应。如果出现胃脘部持续不适、恶心、腹泻或皮肤出现红疹、瘙痒等异常情况，应及时咨询医师或药师，由专业人士判断是否与服药相关以及后续处理方案。切勿自行判断或继续服药。同时，应避免食用生冷、油腻、辛辣的食物，以免刺激胃肠，影响药效或诱发不适。服药期间应注意休息，保持规律作息，避免过度劳累。由于缺乏明确的孕期和哺乳期安全性数据，相关女性人群应禁用。正在使用其他药物的患者，就诊时应主动告知医生，以避免潜在的药物相互作用。最重要的是，该药物为处方药，必须经过中医师辨证后使用，用于肾虚衰老等相应证候，不可作为保健品自行购买长期服用，不对证用药不仅无效，还可能带来健康风险。
