石韦的禁忌主要包括孕妇禁用、过敏体质者慎用、脾胃虚寒者不宜长期服用、避免与寒凉药物同用、出血性疾病患者慎用等。石韦具有利尿通淋、凉血止血的功效，但使用不当可能引发不良反应。
石韦性微寒，可能刺激子宫平滑肌收缩，增加流产风险。孕妇服用后可能出现下腹坠痛、阴道出血等先兆流产症状。妊娠期女性应避免使用含石韦的中药方剂，如八正散、石韦散等。若误服出现不适，需立即停用并就医监测胎心。
石韦含绿原酸、黄酮类等成分，可能诱发皮肤瘙痒、红斑等过敏反应。既往对蕨类植物过敏者，使用石韦后可能出现喉头水肿、呼吸困难等严重症状。建议首次服用时减半剂量观察，出现唇舌麻木需立即停药并抗过敏治疗。
长期服用石韦可能加重腹痛腹泻等虚寒症状。脾胃虚弱者表现为食欲减退、大便溏稀时，应避免单独使用石韦。临床常配伍白术、党参等温补药材中和药性，如参苓白术散加减方。
石韦与黄连、栀子等寒性药物联用可能损伤脾胃阳气。治疗淋证时需避免与八正散、导赤散等方剂叠加使用。老年患者合用后易出现畏寒肢冷、完谷不化等阳虚表现，建议间隔2小时服用。
石韦的活血作用可能加重紫癜、血友病等出血倾向。血小板减少者服用后可能出现牙龈渗血、皮下瘀斑。使用华法林、阿司匹林等抗凝药物期间，须在医生指导下调整石韦用量。
服用石韦期间应忌食生冷油腻食物，避免加重胃肠负担。出现恶心呕吐等不适时可饮用生姜红糖水缓解。建议定期复查肝肾功能，连续用药不宜超过2周。治疗泌尿系统感染时，可配合饮用玉米须茶增强利尿效果，但需保持每日饮水量2000毫升以上。使用前建议由中医师辨证施治，不可自行配伍或超量服用。
